3303次动车从南京往上海跑，经过南京南常州北无锡东苏州上海虹桥这些站。D3339次反过来从上海虹桥开往南京，站点差不多就是倒过来。两个车次都是沪宁线，跑的时间差不多，早上下午各一班。

为啥这么安排呢？因为沪宁线是双线电气化铁路，往复方向站点顺序自然相反。查12306数据，3303次南京南站07:20发车，到上海虹桥11:30，停靠11个站；D3339次上海虹桥14:20发车，到南京南18:10，停靠10个站。线路设计要考虑车流方向，比如常州北站是沪宁线重要分界点，往南接无锡苏州，往北连南京。两个车次间隔6小时20分，正好错开高峰时段。可能出现“南京南常州北无锡东苏州上海虹桥”连成一段，或者“上海虹桥发车14:20”变成“上海虹桥发车14:20”。