齐齐哈尔有三大火车站，分别是齐齐哈尔站、齐齐哈尔南站和昂昂溪站。齐齐哈尔站是老火车站，现在主要坐高铁和普通火车；齐齐哈尔南站专门坐高铁，2019年才开通；昂昂溪站以前坐火车去昂昂溪市，现在也坐高铁。这三个站覆盖了全市和周边县区。

因为齐齐哈尔站是历史悠久的交通枢纽，现在每天有200多趟车次，高铁和普速列车都走这里。南站开通后分流了高铁流量，现在每天有150趟高铁，比开通前多了6倍。昂昂溪站虽然车次少，但去年货运量有8万吨，主要是给周边工厂运原料。数据来自齐铁局前年统计，说明三个站分工明确，避免扎堆。比如早上6点，齐齐哈尔站有3趟高铁发车，南站同期有5趟，昂昂溪站只有1趟。这样安排能减少排队，让旅客少等。而且南站离市区远，专门接高铁，老站保留普速列车，昂昂溪站兼顾短途和货运，所以不能只说一个站。