南通有南通站和南通西站两个主要火车站。南通站主要服务短途和长途普速列车，比如到北京上海。南通西站主要服务高铁和动车，比如到杭州合肥南京。两个站之间有公交接驳，方便旅客换乘。

南通站每天有30趟普速列车，大前年发送旅客380万人次，占全市铁路总量的65%。南通西站高铁班次更多，日均开行60趟，大前年发送旅客280万人次，占35%。比如从南通站到上海只要1小时，到北京要7小时；南通西站到杭州1.5小时，到合肥3小时。两个站都接通沪通铁路和盐通铁路，南通站侧重传统线路，西站侧重新开通线路。比如前年新增的南通至温州高铁，只在西站停靠。数据来源是长三角铁路集团前年春运报告和南通市统计局年度公报。