阿克苏夏天热得要命，冬天冷得刺骨，早晚温差特别大，白天穿短袖晚上盖被子都常见。春季刮大风，沙尘暴有时候突然就来了，秋季天气最好，凉快还不刮风。一年四季降水少，蒸发特别快，河流夏天水量大冬天基本断流。

因为阿克苏在塔里木盆地北缘，周围山脉挡住了水汽，所以降水少得可怜，年降水大概66.7毫米左右。这里属于大陆性气候，夏季极端高温出现过42.3℃，冬季最低温能到-24℃。昼夜温差大是因为白天太阳晒得快，晚上地面散热又快，比如7月白天26℃晚上可能骤降到10℃。春季3-4月风沙多，和北边蒙古国的沙尘暴有关，每年这时候PM10浓度会飙升到500微克每立方米。秋季9-10月最舒服，气温稳定在15-25℃之间，这时候来旅游的人特别多。河流方面，阿克苏河夏季流量占全年70%，冬天完全结冰，所以冬天去河滩玩特别危险。