剥皮菠萝放三天就变质，冷藏能延长到一周，冷冻可存一个月。用盐水泡十分钟或加两片柠檬，切面裹保鲜膜再装密封袋，冷冻前焯水更保险。

因为菠萝本身含酶和糖分，削皮后表皮氧化发黄，微生物在室温下每四小时数量翻倍，所以必须及时处理。冷藏时温度降到四度能减缓酶活性，但切面仍会接触空气，盐水中的柠檬酸能抑制细菌繁殖，实验数据显示盐水浸泡后细菌数量减少78%。冷冻前焯水能破坏细胞结构，锁住水分，这样解冻后口感更脆。有研究说冷冻菠萝解冻后糖分流失15%，但保鲜膜包裹能减少氧化，所以冷冻保存一个月还能吃，只是果肉会略变软。