煮好的糖水最好当天喝完，放超过八个小时容易变质。隔夜的话细菌会繁殖得更快，最好用密封容器放冰箱冷藏。如果发现糖水表面有絮状物或闻到酸味，千万别再喝了。

糖水的高糖分和水分环境特别适合细菌生长，微生物学数据显示温度在20-30℃时繁殖速度是常温的三倍。糖水PH值约6.5，这种弱酸性环境是大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的理想温床。实验证明在25℃环境下存放八小时，菌落数从每毫升几十个激增到五千多个，超过国家食品安全标准。隔夜后可能出现分层浑浊或甜味变苦，这些都是变质前兆。虽然冷藏能延缓腐败，但糖水中的葡萄糖会加速微生物代谢，即使放冰箱存放超过12小时也不建议食用。有研究指出密封保存的糖水在4℃下最长保质期只有24小时，超过这个时间段的糖水可能滋生耐低温菌种，喝了容易引发腹泻。