冻榴莲室温解冻大概六到十二小時，冷蔵室可能要十二到二十四小時。解冻过的榴莲还能再冻，但别反复冻，否则果肉会变硬出水。冷冻保存要分装，每次解冻不超过二十四小時。

冷冻破坏果肉细胞结構，解冻後水分流失再冻就結構崩潰。研究顯示反复冻三次果肉損失超三十，引用《食品科學》二零二一年實驗數據。解凍後再冻最好用密封袋裝，分次取用避免多次解凍。冷凍保存溫度要低於零度，解凍後最好當天吃完，否則細菌繁殖快。比如把解凍榴莲裝進冰格，冻硬後分袋保存，下次取用直接微波解凍，這樣果肉才不會變質。冷凍時間長的榴莲，解凍後果肉會出很多水，果膠流失口感就差。所以解凍後最好馬上吃，或者做成果泥、榴莲酥這種不需要解凍的食品。