玉环县有漩门江、清江、长山塘三条主要河流被污染。这些河的水色发黑发浑，漂着塑料袋和油污，岸边堆满建筑垃圾。去年监测数据显示，漩门江部分河段COD（化学需氧量）超标2.3倍，氨氮浓度是Ⅲ类水标准的3倍。清江下游出现蓝藻爆发现象，长山塘岸边有20多处污水直排口。

造成污染主因是沿河企业偷排废水。漩门江畔有37家化工企业，其中12家被查实每月偷排超过50吨含重金属废水。清江沿岸的6个养殖场去年违规排放粪污1.2万吨，导致河底淤泥重金属超标8倍。生活污水收集率不足60%，玉环市中心城区每天有8000吨污水未经处理直排河道。大前年环境局统计，全县河流总磷含量比五年前上升47%，直接原因是农业化肥使用量增加35%。虽投入3.2亿治理，但仅完成项目计划的40%，像清江的生态浮岛工程拖延两年未完工。现在每天仍有200吨工业废水混着生活污水往河里倒，导致漩门江入海口海蛎子绝收，清江段鱼类死亡量同比增加120%。