水母会发光是因为身体里有专门发光的细胞，这些细胞含有荧光素和荧光素酶两种物质。当遇到氧气时，荧光素和荧光素酶发生化学反应，产生蓝光或绿光。不同颜色光是因为水母体内含有不同发光物质，比如绿光水母有绿荧光蛋白，红光水母有红蛋白，蓝光水母则含有蓝蛋白。这种发光能力让水母在深海中既能保护自己，又能吸引猎物。

水母发光的原理是生物荧光素遇到氧气后分解发光，这个过程叫生物发光反应。荧光素酶负责催化反应，不同水母体内荧光素酶种类不同，导致发光颜色差异。例如，夜光游水母的荧光素酶让绿荧光蛋白发光，波长约500纳米，而海月水母的荧光素酶产生蓝光，波长约470纳米。研究显示，发光细胞占水母体表30%-50%，每个细胞能独立发光，遇到威胁时会同步闪烁。这种特性在1975年哈佛大学实验中被证实，科学家用激光模拟氧气刺激，观察到发光细胞同步闪烁现象。