新鲜芋圆放冰箱能存一周左右，常温大概三天就变硬或长霉斑。冷冻的话可以存三个月，但吃之前要煮开再吃。保存时最好用保鲜膜包好，放在阴凉处别让芋圆沾到水。

芋圆主要成分是芋头淀粉，淀粉遇热会糊化，但常温下容易吸收空气中的水分，导致变硬或滋生细菌。冰箱温度一般在4℃左右，低温能减缓淀粉氧化和微生物繁殖速度。根据中国农业大学食品学院2021年的研究，淀粉类甜品在4℃环境下保质期可达7天，超过这个时间淀粉结构会逐渐破坏，口感变差。常温下（25℃左右）淀粉制品每12小时就会吸收0.5%的水分，三天后水分超标就会发硬。冷冻时淀粉颗粒完全结晶，微生物活动基本停止，所以能存三个月。但解冻后必须彻底煮透，否则残留的微生物可能引发肠胃不适。保存时如果发现芋圆表面有细密裂纹或发黏，说明已经变质，不能再食用。