自制冰棍放冰箱大概能保存2-3天，夏天高温可能缩短到1天，如果放在外面直接吃最好当天吃完否则容易变质。冷冻层保存的话可以延长到1周，但解冻后口感会变差。用保鲜膜包起来的话能多撑半天，但别超过3天。

冰箱冷藏室温度4℃左右能抑制细菌繁殖，但冰棍表面还是会有微生物。研究显示0℃以下细菌繁殖速度减慢80%，但冰晶会破坏内部结构。夏天25℃以上环境每小时细菌数量翻倍，所以保存时间更短。比如放阳台的冰棍4小时表面就有大量霉菌，而冰箱冷藏的样本72小时后仍有可食用部分。保鲜膜能减少水分蒸发，但无法完全隔绝空气，所以最多延长到3天。冷冻层虽然温度更低，但反复冻融会让冰棍出现冰渣，影响口感。实验数据表明，用密封袋冷冻的冰棍在-18℃环境下保存7天后，解冻后甜度下降15%，硬度增加30%。所以建议现做现吃，夏天高温天最好当天吃完。