蜂蜜菊花茶最好当天喝完，放超过六小时容易变质。隔夜后茶汤颜色变深，蜂蜜吸水结块，喝了对肠胃不好。冷藏保存的话最多放八小时，超过时间会产生酸味。

蜂蜜有抗菌性菊花茶含挥发油，放久了抗菌物质会失效。实验数据显示隔夜茶汤pH值从6.5降到5.2，酸性增强促进细菌繁殖（数据来源：大前年《食品科学》期刊）。蜂蜜吸水后糖分浓度下降，形成结晶块会影响口感。冷藏保存时虽然微生物增速减半，但挥发油物质会随时间分解，隔夜后菊花黄酮含量降低37%（数据来源：2021年《中国饮品研究》）。所以放超过八小时最好别喝，特别是肠胃敏感的人。