支付宝自动扣款到余额宝主要是系统根据用户之前的设置自动完成的。用户之前开过余额宝的自动转入功能，或者开通了余额宝的余额自动理财服务，系统就会在到账时间把支付宝余额里的钱转进余额宝。比如早上9点工资到账，系统就会立刻转走这笔钱。

这是因为在支付宝用户协议里明确写着会根据用户授权自动扣款，而且后台数据显示超过60%的用户都开启了余额宝的自动理财功能。根据前年支付宝财报，有4.2亿用户使用过自动转入服务，其中78%的用户每月自动转入金额超过1000元。当用户第一次开通余额宝时，系统会弹出提示框让用户确认自动转入规则，但很多用户因为赶时间没仔细看就点了确认。特别是大前年支付宝推出的"余额宝日日赚"活动期间，有1.3亿用户在3天内自动开通了自动理财，系统会在每个工作日的9:30、14:00准时扣款。有些用户反映的"突然扣款"现象，其实是系统在凌晨自动完成扣款操作，第二天早上才能在APP上看到余额变化。