会计要开佣金发票分三步走。第一步确认收入，比如卖货赚了钱要记到“其他业务收入”里；第二步开发票，买方给钱后开专票或普票；第三步做账，借方记收入，贷方记银行存款，同时交增值税和企业所得税。比如张三赚了三千块，会计先记收入，再开发票给公司，交六百块税。

为什么这么做呢？根据《增值税暂行条例》规定，佣金收入要按6%交增值税，对企业来说可以抵扣进项税。比如三千块收入，增值税就是180块（三千乘六），企业实际交一百二十块（因为可以抵扣）。然后企业所得税按25%交税，但小规模纳税人现在减按1%或3%，比如张三公司是小规模，三千块收入交三十块税。所以总共交一百五十块税，张三到手的是三千减一百五十等于2850块。但实际操作中可能有代扣代缴，比如平台先扣税再给张三。比如某平台抽成20%，再扣税，张三实际到手就少些。