POX染色阴性就是说细菌没有过氧化物酶，常见于像链球菌葡萄球菌这些革兰氏阳性菌，还有像大肠杆菌这样的革兰氏阴性菌。这种情况下细菌遇到过氧化氢就不会变色，医生或实验室人员通过染色结果就能初步判断细菌类型。比如金黄色葡萄球菌的POX活性低，染色阴性时更容易被误认为非致病菌，但实际它还是可能引发皮肤感染。

为什么会出现POX染色阴性呢？主要是细菌的酶系统不同导致的。革兰氏阳性菌细胞壁厚，含有大量肽聚糖，过氧化物酶活性普遍较低，像肺炎链球菌的POX活性只有0.3-0.5U/mg，比大肠杆菌（1.2U/mg）低一半。这种差异跟细菌的进化路径有关，革兰氏阴性菌外膜含有脂多糖，需要更多过氧化物酶来保护细胞膜。实验数据显示，在37℃培养24小时后，80%的革兰氏阳性菌POX染色阴性，而65%的革兰氏阴性菌显示阳性。不过要注意环境温度和培养时间会影响结果，比如在25℃培养48小时后，部分大肠杆菌的POX活性会下降30%。