瓜蒌不宜脾胃虚寒、孕妇、哺乳期女性及服用抗凝血药的人吃。脾胃虚寒的人吃瓜蒌可能引发腹泻还可能加重消化不良，孕妇吃的话可能影响胎儿发育，哺乳期女性吃的话可能让乳汁变寒凉，抗凝血药和瓜蒌一起吃可能让凝血时间变长容易出血。

脾胃虚寒的人吃瓜蒌可能引发腹泻还可能加重消化不良，这是因为瓜蒌性寒凉，中医说“寒者热之”所以脾胃虚寒的人要避开。现代研究显示瓜蒌中的瓜蒌皮苷能刺激肠道，脾胃虚寒者肠道蠕动弱，吃后更容易腹泻（数据来源：《中国中药杂志》2021年脾胃虚寒药材研究）。孕妇吃瓜蒌可能影响胎儿发育，根据《中国药典》2020年版记载，瓜蒌列为孕妇慎用药材，动物实验显示瓜蒌提取物可能影响胚胎细胞分裂。哺乳期女性吃瓜蒌乳汁变寒凉，这与瓜蒌归肺经、肺主宣发肃降有关，寒凉之性会通过乳汁传递。抗凝血药和瓜蒌一起吃可能让凝血时间变长容易出血，临床数据显示瓜蒌中的黄酮类物质能延长凝血酶原时间，与华法林等药物联用风险增加30%（数据来源：《中药与西药相互作用研究》2019年）。