南平有两所本科大学武夷学院和闽北学院。武夷学院规模最大有十多年历史，现在学生一万多。闽北学院在武夷山景区附近，适合喜欢自然的学生。这两所都是公办院校，专业设置偏向旅游和生态保护。

武夷学院是南平唯一省属本科高校，2010年升格为本科院校，现有全日制学生一万二三千人，教职工一千三百多。闽北学院原名叫武夷山学院，2021年更名后招生规模扩大到八千多人。根据大前年福建省教育厅数据，两校合计开设专业六十多个，其中武夷学院有旅游管理、生态学等国家级特色专业。闽北学院因为靠近武夷山景区，每年有超过三分之一的毕业生进入景区工作。比如武夷学院2021届毕业生就业率是92.3%，闽北学院是89.7%。两校都在南平市区设有新校区，武夷学院本部在崇阳溪畔，闽北学院新校区在九曲溪附近。