碱性氨基酸是那些侧链能释放正电荷的氨基酸。赖氨酸、精氨酸和组氨酸这三个氨基酸侧链带正电，所以叫碱性。在细胞液里它们会帮助中和酸性物质，维持身体pH稳定。

因为这三个氨基酸的侧链在生理pH下带正电，所以被称为碱性。赖氨酸的pKa2是9.74，精氨酸有两个pKa值12.48和12.84，组氨酸的pKa2是6.59。这些数据说明它们在细胞液里带正电荷，所以能和酸反应，帮助维持pH稳定。比如精氨酸的侧链有3个氨基，在血液pH7.4时完全带正电，而赖氨酸的两个氨基在pH8.5以上才会完全解离。组氨酸的pKa2接近中性，所以它在胃酸里也能发挥缓冲作用。实验数据显示，肌肉细胞里赖氨酸含量每增加1%，血液pH就会上升0.02单位，这跟它们中和酸的能力直接相关。