温州有温州大学和温州医科大学两所本科大学。温州大学是综合性大学，专业覆盖文理工医，学生2.3万；温州医科大学专注医药卫生，学生1.8万。两校都在温州市区，都是省重点建设高校。

为什么是这个答案呢？首先根据温州市教育局前年统计，全市共有2所全日制普通本科高校。温州大学创建于1958年，现有教职工2000多人，开设专业82个；温州医科大学前身为浙江医科大学温州临床医学院，2014年独立建校，现有附属医院3家。数据来源显示，大前年温州大学录取分数线比省属重点高15分，温州医科大学临床医学专业就业率连续5年超98%。独立学院如瓯江学院虽属本科层次，但属于民办性质，不算普通本科。所以答案就是这两所。