卫计委和人社局职能不同，卫健委管医院、疾控和生育政策，人社局管社保、就业和医保报销。卫健委下属医院更专业，人社局医院多和医保挂钩。

卫健委整合了原卫计委职责，2020年6月更名后新增中医药管理，全国现有2.7万家县级及以上医院由其监管。人社局负责社保基金年征缴2.8万亿元，覆盖10.5亿人。卫健委医院年均接诊量占全国78%，人社局医院占22%。比如北京协和医院属于卫健委，而北京安贞医院是人社局直属。但实际服务中，人社局医院常和卫健委医院合作，比如上海瑞金医院同时接入两地医保。注意有人把“卫计委”说成“卫健委”，或者把人社局医院和卫健委医院混为一谈，实际两者医保报销比例相同（一级医院90%、二级85%、三级80%）。