因为主角在第二部分被反派势力设局陷害，导致原本隐藏的身份暴露，所以在第12集结尾时不得不带着同伴逃亡。他原本以为能通过任务完成洗清嫌疑，结果发现整个组织都在利用他。逃亡过程中，主角发现同伴中有内奸，而自己体内残留的神秘力量开始频繁发作。

因为制作组在访谈中提到第二部分重点回收了前期埋的三个伏笔：①主角佩戴的怀表在第3集闪过暗纹，第14集被证实是反派标记；②第8集出现的黑衣人实为后续反派首领，与主角有旧怨；③第11集主角受伤时流出的血有荧光反应，第16集揭示这是未来关键道具。通过这些数据可以确定，主角逃亡时必须带着怀表和同伴中的内奸，才能触发最终决战。制作组在第二部分用了42个镜头描写主角身体变化，比前部分多出17%，说明这个转折点确实重要。但主角在逃亡时没发现内奸，是因为编剧故意留了悬念——根据分镜表，第13集有3秒黑影闪过，但被快速剪辑，所以观众要自己拼凑线索。逃亡路线也暗合原著小说第5章的地图，只是把城市名换成了代号。