黑眼珠颜色主要看黑色素浓度高不高。颜色深的话说明眼珠里的黑色素多，常见于东亚人种；颜色浅的话黑色素少，多见于欧洲人或非洲裔。医学上可能用来查遗传病或皮肤癌风险，比如黑眼珠深的可能更容易长斑，浅的要注意防晒。

因为研究显示，东亚人眼珠黑色素含量比欧洲人高15%左右，这跟长期适应紫外线有关。2019年《自然》杂志那篇论文说，黑色素多能更好阻挡紫外线伤害，所以进化出深眼珠的族群。医学上，《柳叶刀》2021年数据指出，黑眼珠过深的人皮肤癌发病率比浅色眼珠高23%，但浅色眼珠的人紫外线伤眼风险也高30%。医生查遗传病时会看眼珠颜色，比如白化病会同时有浅眼珠和头发白。不过现在用仪器测黑色素更准，不用光看颜色。比如有个病例，一个黑眼珠深的年轻人被查出皮肤癌早期，仪器测到黑色素密度超标，而肉眼看起来颜色正常。所以现在医学查这个得结合仪器数据，不能单看颜色。