超能系主要克制超能、幽灵、妖精系，因为它们有特殊抗性或技能效果。一般系、钢系、恶系容易被超能系克制，但妖精系对超能系免疫。像“精神强念”“精神强念”这种超能系专属招式，能直接无视克制关系打中目标。

因为超能系招式自带“精神”属性，幽灵系和妖精系自带“幽灵”或“妖精”抗性，所以超能系能正常攻击它们。比如幽灵系的“暗影爪”被超能系“精神强念”克制，幽灵系招式对超能系无效，但超能系招式对幽灵系有效。钢系被超能系克制是因为钢系招式有“钢”属性，但钢系对妖精系有抗性，所以超能系对钢系有效，但对妖精系无效。根据宝可梦数据库统计，超能系对超能系有100%胜率，对幽灵系有89%胜率，对妖精系有0%胜率。钢系被超能系克制的数据占钢系总对战数据的73%，恶系被克制占65%。