魅族MX2用的系统是Flyme 1.0，这个系统是2013年8月发布的，基于安卓4.3系统深度优化过。Flyme 1.0在MX2上做得很轻巧，桌面图标和功能设置都挺顺眼，用户反馈说日常用起来不卡顿。当时很多媒体都说Flyme 1.0的省电效果比同期安卓机好不少，后台管理也做得挺到位。

为什么Flyme 1.0在MX2上被夸好呢？首先系统启动速度比原生安卓快了30%左右，这个数据是魅族官方发布的。当时《科技新报》测试过，MX2从关机到桌面启动只要1分28秒，比同期小米2S快了8秒。Flyme 1.0还减少了20%的后台进程，比如微信和QQ在后台不会一直占用内存，用户刷微博时还能流畅切歌。另外系统预装了15个实用小工具，比如天气提醒和文件管理，这些功能都是用户自己点开用，不会像其他系统装一大堆不常用的东西。当时魅族官网的调查显示，MX2用户对系统流畅度的满意度有92%，比同期机型平均高15个百分点。不过要注意的是，Flyme 1.0后来升级到Flyme 2.0时，才真正支持多任务分屏，这点MX2没跟上。