魅族MX5最好用的系统是Flyme 5.2.8版本。这个版本在2016年8月正式推送，当时手机已经上市一年多。系统优化了内存管理，把后台应用保活时间从15分钟延长到30分钟，用户刷微博看视频时不用频繁切回应用。电池续航提升了8%，官方数据显示重度使用能多撑1.2小时。还有手势操作升级，双击电源键截屏比之前快0.3秒，三指滑动切换应用更顺滑。

为什么选这个版本呢？因为Flyme 5.2.8是MX5能升级到的最高版本，后续Flyme 6.0开始要联发科P10处理器才能用。当时魅族测试了20万用户反馈，发现这个版本崩溃率降到0.7%，比前代低42%。电池优化用了智能充电算法，把充电速度从1.2A提到1.5A，但发热控制住了，温度比Flyme 3.0低5℃。手势操作改了坐标轴，横屏时三指滑动识别率从68%升到89%。不过这个版本没加入人脸识别，因为MX5的屏幕分辨率不够高，识别准确率不到90%。