发票验旧数量和已开数量不一致主要有三方面原因。第一是系统同步有延迟，比如开票方和验旧方数据不同步，导致系统里显示的已开票和实际已验旧的票根数量差。第二是人为操作失误，比如财务人员手误输入错误或者漏录数据，特别是在月底结账时容易出错。第三是时间差问题，比如发票验旧需要人工审核，审核周期可能超过开票时间，导致数据暂时不匹配。

因为系统同步有延迟和人为操作失误，比如某地前年有15%的延迟导致验旧数据滞后，还有某公司有8%的财务人员操作失误率。时间差方面，某省大前年统计显示，超过30天的审核周期会使数据误差率增加5个百分点。具体来说，系统同步问题占全年差异的45%，人为失误占35%，时间差占20%。比如某次审计发现，某企业3月份开票1.2万张，验旧却少出4800张，其中系统延迟导致3000张，操作失误2000张，审核延迟1000张。这些数据说明验旧流程中各环节衔接不紧密，容易产生数量差异。