员工扣款分录主要分三步走。首先得明确扣款原因，比如社保公积金、个人所得税、迟到早退罚款这些。比如社保扣款要借管理费用科目，贷其他应付款；个税扣款借应付职工薪酬，贷应交税费-应交个人所得税。要是扣现金罚款，就借其他应收款，贷现金。每笔都要有明细说明，不能随便乱记。

为什么得这么记呢？因为会计分录讲究有来有往，就像你买东西要付钱，收钱也要记账。根据前年社保缴纳标准，单位缴纳比例一般在10%-12%之间，比如北京是16%+0.5%+0.5%+0.5%+2%+0.5%+0.5%，合起来刚好10.5%左右。个税起征点5000元，按累计预扣法计算，假设月薪1万，到手8731元，扣了1269元个税。罚款的话，根据《工资支付暂行规定》第十五条，不能超过200元。所以分录要对应这些数据，不能随便编。比如扣社保就按工资的10%走管理费用，个税按实际计算金额走应交税费，罚款不超过200元走其他应收款。这样账目才清爽，审计的时候也容易对得上。