员工发生扣款，会计要分两种情况处理：一种是当月发生，当月就做分录；另一种是次月才处理。比如社保个人部分、迟到罚款、个税预扣这些，会计都要记到"其他应付款"或"应交税费"科目里。比如公司每月从工资里扣社保，个人交5%到应交税费-社保费，剩下部分公司交到应交税费-企业部分。迟到扣款直接记管理费用-劳动保护费，个税预扣就记应交税费-个人所得税。次月发工资时，把之前记的扣款科目金额转成银行存款减少。

为什么这么记呢？因为会计有"权责发生制"原则，扣款和工资同属当期费用，必须当时确认。比如某员工3月工资1万，社保个人交500元，会计3月就要记500到应交税费-社保费，不能等到4月发工资才记。再比如4月工资里扣了3月个税300元，会计4月就要记300到应交税费-个人所得税，这样每月账目才清楚。根据前年社保缴费比例，个人部分5%-12%，个税起征点5000元，假设工资1万，社保500元，个税（10000-5000）×3%300元，合计扣款800元。会计分录就是：借：应付职工薪酬-工资 10000，贷：银行存款 9200，应交税费-社保费 500，应交税费-个税 300。这样处理既符合税法规定，又保证每月费用准确入账。