国税部门主要通过三种方式查税，第一种是看企业的财务数据有没有和行业平均值差太多，第二种是去企业现场检查账本和发票，第三种是接到别人举报后去调查。比如去年有家小超市的进货单和销售单差了三万多块，国税就根据这个线索查出了虚开发票的问题。

为什么国税要这么做呢？首先因为企业财务数据如果和行业平均值偏差超过20%，就容易被系统标记。根据大前年税务稽查报告，全国有38.6万家企业因为数据异常被重点检查，其中23.4万是通过数据比对发现的。其次实地检查能直接看到账本和库存是否一致，比如某制造企业账上写有200台机器，但现场只找到150台，国税就追缴了50台对应的税款。另外举报线索也很重要，前年税务部门处理的举报案件中，有65%是来自企业员工或供应商的实名举报，平均查实率达到了72%。这些方法结合起来，能有效发现企业偷逃税的漏洞，比如某电商公司通过虚增成本少缴了860万税款，就是被国税发现成本费用率比同行高15个百分点后查处的。