扣迟到做分录就是给公司账上记一笔钱，说明公司扣了员工的钱。这属于经济处罚的一种，因为员工没按时到岗影响了工作安排。具体分录是借记管理费用，贷记其他应付款，等员工补交后再转回工资里。比如迟到半小时扣50块，就先记50块到管理费用里，等发工资时再从工资里扣出来。

为啥这样记分录呢？因为根据《劳动合同法》第三十九条，严重违反公司规章制度可以解除合同，但日常迟到属于轻微违规。劳动部门规定每月扣款不超过工资的20%，所以公司最多能扣工资的20%当月工资。比如月薪5000元，最多扣1000元。分录这样做是为了把罚款和正常工资分开，方便查账。比如王师傅迟到三次，每次扣50元，总共扣150元，就先记管理费用150元，发工资时再从工资里扣。这样公司账上能清楚看到罚款支出，员工工资明细也写得明白。要是直接扣工资不记分录，万一员工问起，公司就说不清哪部分是工资哪部分是罚款了。