总包公司收钱后要扣税，先交增值税和附加税给税务局，再分给分包企业部分钱，让分包自己交剩下的。分包企业拿到钱后，要自己算清楚该交多少税，按月或按季去税务局交钱。

为啥要这样交税呢？因为国家规定总包要当“代扣代缴人”，像前年建筑行业增值税税率9%，附加税3.91%，总包先交全款给税务局，再按合同分钱给分包。比如总包拿100万工程款，先交100万×9%增值税=9万给税务局，再分给分包80万，让分包自己交80万×9%增值税=7.2万。政策依据是财税[2016]36号文，现在很多地方税务局还要求总包代扣分包的社保费和个税。不过要注意，分包如果没实际施工，总包可能不用代扣，得看合同怎么签。