税务局查账征收所得税主要是看企业自己做的账对不对。他们要核对企业的收入、成本、利润这些数据，检查有没有虚报或者漏报。比如说有个小超市，税务局会拿他们卖东西的流水单和买货的发票对比，如果流水单收入比发票金额高，可能就要补税。要是账目清楚，税务局就按实际利润算税，多退少补。企业要是自己搞虚的，被查出来轻则罚款，重则影响信用。

为什么这样查账呢？因为企业自己报税容易出错，税务局通过查账能发现虚报漏报。比如大前年数据显示，查账征收企业补税比例比核定征收低40%，说明查账更准确。企业看到这个，会更认真做账，避免被查到问题。比如有个制造厂，去年查账发现他们把加班费记成成本，结果多交了15万税。税务局还定期抽查行业数据，比如餐饮业平均毛利率是25%，如果企业毛利率突然变成30%，税务局就会重点查。这种查账方式既防企业偷税，又让国家多收税，企业也少挨罚。查账结果要企业签字确认，要是异议的话，可以申请行政复议。