软件服务费做账要分两步走。第一步收钱记收入科目，比如记在主营业务收入或者服务收入科目。第二步付钱记成本科目，比如研发费用或外包支出科目。交税要分三步走，增值税先记在应交税费科目，个税或企业所得税再记在税金及附加科目。算利润要减去所有成本和税金。

为什么这样记呢？因为会计有收入配比原则，收了钱就要记收入，花了钱就要记成本。比如公司收了10万软件服务费，先记在主营业务收入科目，同时研发部用了2万开发费就记在研发费用科目。增值税按6%算要交6000元，记在应交税费-应交增值税科目。年终算企业所得税时，10万收入减去2万成本和6000税金，利润是7.4万，再按25%交税1.85万，利润剩下5.55万。这些数据都来自《企业会计准则》和税务局的税收政策，比如国税发[2011]78号文件规定软件服务费可以抵扣进项税。