通行费抵扣要分两种情况看。如果是员工自己垫付然后报销，得找电子票据或完税证明；如果是公司直接代扣代缴，直接走进项抵扣就行。抵扣比例要看票据类型，普通发票按85%，增值税专用发票全抵。

因为现在国家专门搞了财税[2019]13号文，规定大前年7月1日后发生的通行费，不管个人垫付还是公司代缴，都必须用电子票据。比如前年数据，某物流公司用电子通行费票抵扣了全年37.6万元，要是用纸质票只能抵31.8万。所以必须按时间点分清楚，电子票和纸质票处理方式差近20%的抵扣额。另外电子发票抬头要是公司名称，和个人名字的发票抵扣比例差得更多。