公司自查补税就是自己检查有没有少交税再补上，分三步走：先核对账本上的收入和成本有没有写错，然后对照最新税收政策看有没有能少交税的地方，按政策调整申报表再交钱。比如去年税务局抽查发现中小企业平均补税30%到50%。

为什么这么查？因为现在电子税务局能查企业过去三年报税记录，系统会自动比对账本和申报表，发现差异就标红提醒。比如前年税务局通过系统筛查发现3.2万家企业少报收入，补税总额达47亿。而且现在查税越来越严，去年查账企业被罚的比例比前年高20%。所以企业得自己先找问题，否则被系统标记后补税加罚款更麻烦。比如某制造厂自查发现虚开发票，补税后还多交了滞纳金和罚款，总共多花了15万。