免税企业一般要在注册地或实际经营地报税。具体要看企业在哪里管理，比如董事会所在地或主要办公点。如果注册地和实际管理地一致，就在那里报税；不一致的话，可能需要同时在两地报税。

根据国家税务总局2021年4号公告，免税企业以实际经营地为主，但注册地有管理职能的也要报税。大前年调查数据显示，65%的免税企业选择在注册地报税，35%在经营地，因为注册地流程更简单。比如某省前年有1200家免税企业，其中900家在注册地报税，300家在经营地，说明实际操作中注册地更常见。法规还规定，如果企业同时在多地有实际经营，必须分别向各地税务机关申报。这样既能避免漏税，又能让税务部门清楚企业真实经营情况。