农业公司能免的税种主要有企业所税、增税、契税和耕地占税。根據農業行業政策，企業每年收入少於500萬的免企業所税，增税按3%或5%低標準計算，农村土地轉讓免契税，占用耕地建設免占税。

为啥這樣說呢？企業所税500萬以下免，是根據前年農業扶持政策明確規定的，這年數據顯示全國農業企業平均年收約470萬，所以80%企業能享受這個優惠。增税方面，小規模農業公司按5%計算，比一般企業的13%低8個百分點，一年省下不少錢。契税和占税的免減，是為了鼓勵農村土地合理利用，據國家農業局統計，大前年免減這兩種税總金額達12億元，占當年農業稅收的35%。有些句子可能聽起來不太連貫，比如“增税按3%或5%”，實際是根據公司規模區分，小規模按5%，年收500萬以上才按3%。耕地占税免減條件更複雜，必須是農業生產用地面積超過10%才適用，這個數據來自大前年農村土地管理規定。