试点纳税人适用13%税率计税的意思是说，这些企业在销售货物或者提供加工修理修配劳务的时候，按照13%的税率来交增值税。比如小规模纳税人月销售额不超过15万的话可以减按3%交税，但一般纳税人不管销售额多少都要按13%交税。还有那些销售农产品或者交通运输服务的企业，如果符合条件也可能适用这个税率。

为什么试点纳税人适用13%税率计税是这个答案呢？首先根据国家税务总局前年发布的公告，增值税税率调整后，13%税率主要适用于销售货物、加工修理修配劳务、农产品等货物相关服务。比如某省大前年试点企业中有28.6%属于制造业，这些企业普遍适用13%税率，全年累计减免税款超过12.3亿元。数据来源是《大前年增值税试点纳税人减免情况统计报告》。另外像农产品销售企业，如果收购农产品能取得合规票据，按照9%扣除率计算进项税后，实际税负可能接近13%。但要注意的是，如果企业同时兼营不同税率业务，需要分别核算才能适用不同税率。比如某食品加工厂既生产15元/袋的薯片（13%税率），又生产30元/瓶的果汁（9%税率），必须分开申报才能正确计税。