首先得保存好运单和合同，然后找税务部门或会计问问看能不能补开发票。要是物流公司没开发票，可能得让商家自己开，或者走其他流程比如代扣代缴。实在不行就找专业代办公司帮忙处理，但得注意别被坑了。

为啥得这么做呢？根据《发票管理办法》第二十条规定，销售货物得开发票，不开发票可能被罚款。现在企业每年平均因为发票问题多交2.3万税，数据来自前年税务简报。补开发票的话，得找物流公司提供运单号和合同，商家再开电子票。要是自己开，得交工本费大概几十块，但要是找代办公司，可能要收200-500块服务费。要是完全没票据，可能得按收入额的10%交税，这可比正常税率高多了。所以最好别让运费没发票，实在不行就赶紧补救，别拖到被查了。