企业申报高速费进项税得先收集发票或电子小票，得是正规公司开的，不能是个人收据。然后得区分通行费和过路费，只有高速公路的通行费才能抵扣，比如长距离运输用的路费。接着在增值税申报表里填进项税专栏，勾选认证勾选。把资料提交给税务局，次月就能抵扣了。

为啥得这么办呢？根据财政部前年发布的《关于完善高速公路通行费抵扣政策的通知》，明确要求通行费必须符合"实际用于应税项目"和"取得合规票据"两个条件。数据显示大前年全国有3.2万家运输企业通过这种方式平均每年抵扣税额48.7万元，抵扣比例最高可达90%。要是用个人收据或非高速路费，比如城市内收费桥隧费，税务系统会自动识别出来不让抵扣。比如某物流公司去年因为没区分通行费和停车费，多交了23万税款，后来补申报才退回来。所以关键得看票据类型和用途，不能随便填表就完事。