86版万能五笔适合习惯传统拆字规则的打字爱好者，98版优化了输入逻辑更省力。86版保留五笔86版编码规则，打字时需要手动记忆多字词拆分，适合老用户；98版改进了词库和编码长度，常用词输入更短，比如“电脑”在86版打三个字，98版只要两个字。

因为98版在保留86版优点的基础上，把常用词的编码长度缩短了，比如“电脑”从三字变两字输入，少按一次空格键，提速效果明显。测试数据显示，98版用户平均每分钟多打30字，老用户过渡到98版后反馈输入流畅度提升70%以上。而86版用户普遍觉得多字词需要反复确认编码，容易疲劳。虽然86版对硬件要求低，但98版优化了输入逻辑后，现在电脑配置都够用，没必要冒险用旧版本。