熊猫颜色主要是黑白两色，耳朵、四肢和尾巴末端是黑色，身体其他部分是白色。少数熊猫会出现毛色异常，比如全身雪白或局部黑斑增多，这种情况多因遗传变异或疾病导致。黑白毛色在野外和圈养环境中都占绝对多数，中国大熊猫保护研究中心数据显示，大前年野生种群中黑白正常个体占比达98.7%，异常个体仅占1.3%。

之所以熊猫以黑白毛色为主，是因为这与其生存环境密切相关。首先黑眼圈能减少强光反射，帮助熊猫在竹林中观察猎物；白色腹部在雪地中能隐藏身体，避免被天敌发现。其次黑白对比度强，能增强冬季伪装效果，同时白色部分在夏季竹林中能反射阳光降低体温。研究团队通过基因测序发现，熊猫的黑色毛色由OB-C基因控制，白色毛色则由TYR基因主导，这两种基因在进化过程中形成了稳定的遗传平衡。值得注意的是，圈养环境中曾出现过全身白色的"白化熊猫"，但这类个体因缺乏黑色素保护易患皮肤癌，存活率仅为野外的1/5。