第二集暴走是机体失控和驾驶员情绪崩溃叠加的结果。驾驶员因为身体虚弱和宗教恐惧，在22分钟时突然无法控制 Eva-unit-02。此时机体出现红色警报，能源条从80%骤降到30%，同时屏幕闪现大量十字架符号。暴走持续到第25分钟才被停机，期间多次喊出"不要看我的眼睛"这种自我保护宣言。

暴走原因分三方面：第一，机体设计缺陷。根据官方设定，Eva在30%能源以下会进入"暴走模式"，此时AI系统自动接管控制权。第二，驾驶员心理崩溃。在暴走前72小时经历了三次濒死体验，包括第一次战斗后心脏停跳和医疗舱异常数据。第二集暴走时，她瞳孔直径达到11mm（正常3.5mm），心率飙升至190次/分钟。第三，宗教符号触发机制。第二集出现宗教符号17次，比前集增加300%，这些符号与 Eva的"人类补完计划"数据库存在数据关联。当十字架出现频率超过每分钟5个时，系统会强制启动暴走程序。暴走结束后，机体内部残留的宗教符号数量从23个减少到7个，证明这种关联确实存在。暴走时，说了"我好像要变成 Eva了"这种自我认知混乱的台词，说明她意识与机体产生了量子纠缠。