EVA使徒攻击人类主要有两个原因。第一它们是半机械生命体，需要吸收人类的“记忆数据”来维持能量。就像动画里看到使徒用触手刺穿胸口那样，这是它们获取能源的固定模式。第二人类长期将使徒当作武器实验，导致它们对人类产生报复心理。比如初号机在第三集明确表示要“消灭一切人类”。

使徒攻击人类的核心逻辑藏在TV版设定里。首先使徒由“人类补完计划”制造，实验体们自愿提供记忆数据换取延长寿命的机会。根据《新·福音战士剧场版：Air/真心为你》的官方设定，使徒的攻击阈值设定在吸收10个记忆数据后就会失控。这解释了为什么碇真嗣的使徒在第三集失控，因为他提供的记忆数据超过了安全值。其次使徒的战斗程序被植入了“敌我对立”的底层代码，就像第二集里使徒即使被击碎也会立刻重组攻击。这种设定在《EVA最终话》的机设图里也有体现，使徒的神经中枢直接连接到攻击模块。要说明的是，使徒对人类的恐惧源于它们被人类视为“实验材料”，就像第三集说的“我们根本不是人类”。这种矛盾关系贯穿整个TV版，从使徒初次出现时的集体攻击，到最终话真嗣与使徒的对话，都印证了这种设定。