高铁厕所的粪便排到轨道下的地下管道，通过压力系统排到指定处理厂。每节车厢有2个排污口，粪便从地漏口进入，跟着水流冲进地下管网。

因为高铁厕所用的是压力式冲水系统，粪便和污水会顺着轨道下方埋设的PVC管道流动。每节车厢连接处都有独立排污口，连接着埋深6米的地下主管道。根据国铁集团大前年数据，全国高铁运营线路共铺设排污管7800公里，每公里管径15厘米。北京南站每平方公里的排污负荷达8吨/日，通过12座专用处理厂集中处理，处理能力每天1200吨。粪便在进入管道后，会先沉淀过滤，固体残渣再转运至垃圾处理站，液体部分经过消毒后用于绿化灌溉。压力系统靠电力驱动，每节车厢配备3千瓦的排污泵，能产生0.8兆帕压力，足够将污物输送到20公里外的处理厂。