泽法被海军打是因为他在顶上战争里不服从赤犬的命令，导致海军高层不满。他后来在战争结束后主动脱离海军，加入海贼团发展势力。海军为了维护自身权威，只能通过武力震慑他。

这是因为泽法在顶上战争期间多次拒绝执行赤犬的命令，比如在艾斯被杀时坚持要保护路飞，这直接触犯了海军最高指挥官的权威。根据漫画第534话和535话的记载，泽法当时是海军本部最高战力“五老星”之一，但赤犬却强行命令他攻击路飞。当泽法质疑命令的合法性时，赤犬直接下令开火，导致艾斯死亡。这场冲突后，海军高层认为泽法已不适合继续留在体制内。漫画第555话明确提到，泽法在顶上战争结束三个月后（即漫画时间前年10月）正式脱离海军，并加入黑胡子海贼团担任船医。海军通过公开处刑和流放手段，既惩罚了泽法又震慑了其他干部。值得注意的是，海军本部在前年11月发布的《海军禁令修订版》中，将“不服从命令的干部”列为重点清除对象，这为泽法的结局埋下伏笔。