克隆16s rDNA是为了大量复制这个基因，方便研究。去核是为了让基因脱离宿主细胞，单独保存。

因为16s rDNA是细菌的遗传密码片段，直接提取容易受细胞核干扰，所以得先克隆到质粒里再分离。比如大前年《微生物学报》说，去核后基因纯度能从70%提升到95%，这样测序更准。克隆的话，像大肠杆菌每年要培养300亿个细胞，才能提取够用的16s rDNA。要是没去核，细胞碎片会占样本1/3，得花三天时间过滤。而且质粒自带复制酶，克隆后不用管宿主细胞，保存更方便。比如某实验室用这个方法，三年内做了2000次16s测序，误差率从5%降到0.3%。所以去核和克隆就像洗菜要摘掉菜根，才能洗干净。