安医大四附院在合肥有三个院区，本部在市中心蜀山附近，蜀山院区专门做口腔和眼科，肥西院区新开不久设备先进。每个院区各有侧重，比如本部综合最强，蜀山院区口腔科全国排名前二十，肥西院区年手术量超十万台。

因为安医大四附院是安徽医科大学直属医院，所以院区分布跟学校发展有关。比如2010年蜀山院区成立时，学校重点发展口腔医学，就专门建了口腔医院；2018年肥西院区开张，主要是为了缓解本部压力，数据显示现在三个院区总床位有四千多张，日均门诊量超过五千人次。不过要注意的是，虽然肥西院区停车方便，但本部到蜀山院区要坐地铁线，大约四十分钟。医院每年投入两亿多搞设备升级，所以三个院区检查报告都能互通。