水冲了柱子就赶紧用甲醇或乙腈多洗几遍，然后等它干透再上样。要是洗不干净，柱子顶部的保护层可能被冲掉，导致进样时样品直接流到废液管里。

C18柱子其实是把硅烷基团键合到硅胶颗粒表面的柱子，水冲会破坏这种键合层。有实验显示水洗后柱效可能下降30%以上，因为水分子会插入键合相和固定相之间。比如某实验室用0.1%三氟乙酸水溶液冲C18柱子，检测到峰形变宽、分离度降低明显。这是因为水分子把键合相冲松了，就像用湿手揉捏橡皮泥一样，柱子里的颗粒结构散了架。这时候用高浓度有机溶剂（甲醇或乙腈）多洗几次，能重新洗掉水分子和松散的键合相。但洗完必须彻底干燥，否则残留水分子会继续影响分离效果。