杨志病逝了，是在征方腊之后，长期受苦导致身体垮了，杭州六和寺死的。征方腊打了很多仗，身体累垮了，后来招安了又发配，没死在官府手里，是病死的。

杨志征方腊打了三十多仗，原著第七十一回写得很清楚，他跟着宋江他们从江州打起，到杭州六和寺住持那里养病。第七十二回开头就说他"染病在身，不能任事"，后来在病重时让燕青背他上杭州，结果走到半路就咽气了。水浒传里征方腊的情节有七十一回到八十一回，杨志是唯一没战死的八骠骑之一。他在杭州六和寺去世时，宋江他们刚回来招安，杨志没赶上的大庆功宴，这种命运挺惨的。征方腊的战役里，杨志的兄弟李俊、张顺都战死了，他算是侥幸活下来，但身体拖垮了。原著里写他临死前让燕青背他，这种细节说明他连路都走不动了。所以综合来看，杨志确实是病逝在杭州，不是被官府处死或者被兄弟害死，是长期战争和劳苦导致的自然死亡。